Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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SAMD13Q5VXD3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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SAMD13Q5VXD3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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SAMD13Q5VXD3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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SAMD13Q5VXD3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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