Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD4Q5VX71 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms