Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms