Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q5VSD8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q5VSD8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q5VSD8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms