Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms