Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A13Q5J8X5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A13Q5J8X5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms