Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms