Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms