Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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