Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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