Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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