Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN9AQ15858 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SCN9AQ15858 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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SCN9AQ15858 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SCN9AQ15858 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SCN9AQ15858 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SCN9AQ15858 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SCN9AQ15858 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SCN9AQ15858 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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SCN9AQ15858 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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SCN9AQ15858 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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