Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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