Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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