Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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