Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PDCD1Q15116 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PDCD1Q15116 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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