Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms