Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms