Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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TRAM2Q15035 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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