Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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