Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms