Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNIQ14094 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNIQ14094 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms