Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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