Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms