Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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