Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms