Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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