Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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TRAF1Q13077 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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TRAF1Q13077 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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TRAF1Q13077 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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TRAF1Q13077 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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TRAF1Q13077 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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