Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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FOXF1Q12946 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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FOXF1Q12946 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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