Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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TRAF2Q12933 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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TRAF2Q12933 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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