Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms