Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms