Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms