Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms