Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms