Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms