Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms