Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms