Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEX3Q00994 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms