Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms