Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX3P78415 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms