Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIP4K2BP78356 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms