Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F2P78329 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms