Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG2P63267 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms