Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms