Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms