Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCDC1P59894 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms