Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms