Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LOXL3P58215 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms