Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms